В 1906–1927 гг. В. К. Арсеньев провёл на территории Дальнего Востока, главным образом в Уссурийском крае, целый ряд экспедиций, которые способствовали дальнейшему развитию в регионе географии, биологии, археологии, этнографии. В то время на просторах Дальнего Востока было много таких мест, которые почти не были изучены. На картах того времени, например, пространство Сихотэ-Алиня обозначалось белым полем с извивающимися змейками-реками. В этих условиях необходимо было продолжать дело великих русских первопроходцев, первооткрывателей и дипломатов, заключивших Айгуньский, Тяньцзиньский, Пекинский договоры. Без дальнейшего изучения дальневосточных просторов, их экономического освоения, без единения с аборигенами края можно было потерять то, что с таким трудом открывали и приумножали русские патриоты. В. К. Арсеньеву помогали в организации исследований Дальнего Востока члены Приамурского отдела Императорского Русского Географического общества (генерал-лейтенант И. П. Надаров, генерал-губернатор П. Ф. Унтербергер и др.). Большую роль сыграли экспедиции во главе с В. К. Арсеньевым, проходившие в 1906 и в 1907 годах в горную область Сихотэ-Алиня, расположенную между бассейнами рек Уссури, Имана, Бикина и побережьем Японского моря. Необходимо было собрать научный материал для составления географической карты, изучить флору и фауну малоизученной местности. Казаки-стрелки во главе с А. И. Мерзляковым, биолог Н. А. Пальчевский, проводник Дерсу Узала ответственно относились к работе, преодолевая порой неимоверные трудности. За успешное проведение экспедиций В. К. Арсеньев был награждён орденом Св. Владимира IV степени.

Результативной также была, так называемая, Юбилейная экспедиция 1908–1910 гг., проходившая в честь пятидесятилетия основания Хабаровска и подписания Айгуньского договора. Исследователям необходимо было найти наиболее удобный путь из Хабаровска в Императорскую Гавань, а также собрать материалы по географии, ботанике, геологии, этнографии. Были изучены ряд переходов через хребет Сихотэ-Алинь, обследованы обширные бассейны рек Самарги, Хора, Тумнина, Анюя и побережья Татарского пролива. В ноябре 1910 г. В. К. Арсеньев выступил с докладом об итогах Юбилейной экспедиции на заседании Императорского Географического общества в Петербурге. В северной столице была организована этнографическая выставка, на которой наряду с другими экспонатами, были представлены коллекции Владимира Клавдиевича. Мероприятие посетили дочери Николая II Ольга, Татьяна, Анастасия, Мария. Открытиями талантливого путешественника заинтересовались известные учёные того времени: П. П. Семёнов-Тян-Шанский, В. Г. Богораз, Л. Я. Штернберг и др. В. К. Арсеньеву было предложено написать художественные произведения, в которых он мог бы пропагандировать свои уникальные экспедиции.

В 1911 г. генерал-губернатор Н. Л. Гондатти обратился к Арсеньеву с просьбой оказать помощь по очищению Уссурийского края от иностранных браконьеров (китайских, японских, корейских). Капитан В. К. Арсеньев согласился выполнить это ответственное задание и вместе с учёным Н. А. Десулави, переводчиком и другими помощниками 5 июля 1911 г. отправился на пароходе из Владивостока в залив Святой Ольги. Вскоре на р. Кусуне отряд окружил 38 нарушителей границы из Китая. Удалось задержать китайцев, которые садили на дальневосточной земле опийный мак, а также тех, кто запасал корень женьшень для продажи в Китае.

Осенью 1912 г. отряд во главе с Владимиром Клавдиевичем совершил поход из Владивостока на север с целью выявления новых сведений в области археологии. Вскоре у членов экспедиции появились находки, свидетельствующие о высокой культуре народов каменного века, проживавших на территории Дальневосточного края. Многие из найденных экспонатов (около 100 ящиков) были отправлены в Хабаровский краеведческий музей. В 1917–1918 гг. Владимир Клавдиевич возглавлял экспедиции, способствующие изучению отдалённых населённых пунктов Дальнего Востока, в т. ч. на Камчатке. Будучи по своему мировоззрению истинным демократом, В. К. Арсеньев положительно относился к революционному движению в России и, когда произошла Октябрьская революция, он определённо сформулировал своё кредо: «Революция для всех – в том числе и для меня! Я недолго раздумывал и быстро решил разделить участь своего народа». В. К. Арсеньев ведёт исключительно активный образ жизни. В период установления советской власти на Дальнем Востоке он был назначен комиссаром по инородческим делам Приамурского края. В 1921 г. избирается профессором кафедры краеведения и этнографии Владивостокского пединститута, где пользуется большим авторитетом у преподавателей и студентов.

Более десяти лет учёный возглавлял Хабаровский краеведческий музей: в 1910–1919 гг., 1924–1925 гг. Он обращал внимание на подборку каждого экспоната, определяя его место в музее. Способствовал качественному изготовлению чучел животных, приглашая охотников, которые были ему хорошо знакомы по совместной деятельности.

Занимаясь производственными и общественными делами, В. К. Арсеньев с 1910 г. работал над документально-художественными повестями, которые и по сегодняшний день не потеряли своей ценности, значимости, интереса, переведены на английский, польский, немецкий, французский, японский, итальянский и другие иностранные языки. Это произведения: «По Уссурийскому краю», «Дерсу Узала», «В дебрях Уссурийского края», «В горах Сихотэ-Алиня», «Сквозь тайгу» и др. А. М. Горький по рекомендации критика А. К. Воровского и писателя М. М. Пришвина познакомился с книгой В. К. Арсеньева «В дебрях Уссурийского края» в 1927 г. 24 января 1928 г. классик русской литературы, отвечая на письмо автора, написал следующее: «Книгу Вашу я читал с великим наслаждением; не говоря о её научной ценности, конечно, несомненной и крупной, я увлечён и очарован её изобразительной силой. Вам удалось объединить в себе Брема и Фенимора Купера … Гольд описан Вами отлично, для меня он более живая фигура, чем «Следопыт», более художественен. Искренне поздравляю Вас … подумайте, какое прекрасное чтение для молодёжи, которая должна знать свою страну …»..

Непросто складывалась личная судьба В. К. Арсеньева. В 1918 г. он разошёлся с первой женой Анной Константиновной Кадашевич. В 1919 г. женой писателя стала Маргарита Николаевна Соловьёва. 20 декабря 1920 г. у Арсеньевых родилась дочь Наталья, отличавшаяся любознательностью и красотой. В конце ноября 1918 г. на Украине, в с. Батурино, куда уехали родители Владимира Клавдиевича, неизвестные грабители зверски убили Клавдия Фёдоровича и Руфину Егоровну Арсеньевых. Погибли также брат Клавдий и его жена Елена Леопольдовна, сёстры Ольга и Лидия. В. К. Арсеньев тяжело переживал потерю родных. Однако, будучи исключительно волевой и целеустремлённой личностью, он продолжал всестороннюю деятельность по освоению и развитию края. Осенью 1925 г., находясь в Москве в связи с 200-летием Академии наук, Владимир Клавдиевич выступил с докладом: «Население Дальнего Востока как производительный фактор». В докладе подводились итоги многолетней работы дальневосточных энтузиастов, изучающих край и приступивших к его освоению и развитию.

Во второй половине 1920-х гг. учёным был предпринят ряд экспедиций, имеющих производственное значение. С 1 июня по 1 октября 1927 г. В. К. Арсеньевым и его помощниками В. М. Савичем, Н. Е. Кабановым, А. И. Кардаковским, П. Хутанкой, Ф. Мулинкой и др. был совершён поход от Советской Гавани до р. Амур длиной в 1876 км. Экспедиция пересекла пять водоразделов. Были предоставлены в Географическое общество и управленческие организации ценные этнографические и картографические материалы. В ходе научных экспедиций В. К. Арсеньев и ботаник Н. А. Десулави установили биогеографическую границу, разделяющую хребет Сихотэ-Алинь, по признакам различия флоры и фауны на две части – охотскую и маньчжурскую. Переход от одной флоры к другой оказался поразительно резким, а не постепенным, как первоначально предполагалось. В конце 1920-х гг. впервые были составлены точные географические карты Приамурья и Приморья, на которых реки, озёра, горные хребты были обозначены не приблизительно, а с большой точностью.

В эти годы В. К. Арсеньевым был написан очерк «О двух вариантах трассы проектируемой железной дороги Хабаровск – Советская Гавань», рассказ «Путешествие на молчаливые горы». В докладах, статьях, художественных произведениях В. К. Арсеньев останавливался на необходимости активно вести на территории Дальнего Востока геологические работы. В повести «Дерсу Узала» автор обращает внимание читателей на богатство недр региона: «Всюду на обнажениях я видел кристаллические сланцы и кварцы, окрашенные окисью меди». Талантливые литературные произведения В. К. Арсеньева делают его научные выводы более доходчивыми. Автор показывает конкретные жизненные явления, взаимоотношения людей через призму своего целенаправленного ума и благородного сердца. Закономерен отзыв хабаровской писательницы Ю. А. Шестаковой о художественной прозе Владимира Клавдиевича: «Откройте любую книгу Арсеньева. Независимо оттого, куда вы устремились вслед за автором – на морское побережье или в отроги Сихотэ-Алиня по Амуру, на Анюй или в долину Сучана, – всё равно ощущение близости автора, опытного путешественника, старшего друга, не оставит вас ни на минуту ...».

В. К. Арсеньев обращал внимание на благотворное влияние природы на человека. Соприкосновение с красотой приятно каждому. А дальневосточная природа чаще всего прекрасна по своей сути. Голубые небеса, зелёная разнообразная листва, яркие цветы поднимают настроение, вселяют уверенность. В повести «Дерсу Узала» воспроизводится восхитительный восход солнца: «Картина, которую я увидел, была необычайно красива. На востоке пылала заря. Освещённое лучами восходящего солнца, море лежало неподвижно, словно металл. От реки поднимался лёгкий туман …».

В. К. Арсеньев не мог не оценить значения усилий коренных народов региона по освоению дальневосточных просторов, не мог не заметить положительных основ менталитета этих народов. Не случайно близким другом Владимира Клавдиевича стал гольд Дерсу Узала. Дерсу Узала показан писателем как доброжелательный, трудолюбивый человек с душой ребёнка, проживший всю жизнь в тайге, имевший большой опыт выживания в самых экстремальных условиях. Этот человек, лишенный эгоизма, оказывал путешественникам бескорыстную помощь, неоднократно спасая от неминуемой гибели. В период экспедиций русским энтузиастам приходилось встречаться и с другими аборигенами Дальнего Востока (орочами, удэгейцами и др.). В. К. Арсеньев мечтал написать книгу «Страна Удэхе», но успел написать лишь брошюру «Лесные люди удэгейцы». Народ удэге представлен писателем как умелый, добрый, гостеприимный, но притесняемый и гонимый агрессивными слоями китайского населения в конце XIX – начале XX вв. Хунхузы сгоняли удэгейцев с более удобных южных земель, силой захватывали их женщин, заставляли на себя работать, а при сопротивлении лишали жизни жесточайшим образом. Данная народность смогла сохранить свою специфическую культуру, язык лишь на северных территориях (по рекам Бикин, Анюй, Копи, Мухен). Народу удэге не известна жадность, корыстолюбие, зависть. Это – прекрасные охотники и рыболовы. В. К. Арсеньев писал: «Лесные обитатели Уссурийского края – самые искусные охотники в мире. Они знают повадки всех зверей, знают, где и когда их можно найти, и в этом отношении на всём Дальнем Востоке не имеют себе равных». .Привыкшие с детства к низким температурам, они способны спать всю ночь на морозе легко одетыми под каким-нибудь деревом и не подвергаться после этого простудным заболеваниям. Когда проводника Ладогу спросили, как ему спалось вдалеке от юрты, он шутливо ответил: «Я грел спину на месяце».

В. К. Арсеньев правильно понял своё предназначение и внёс большой вклад в развитие России как путешественник, мыслитель, писатель. Он был честным перед людьми, с которыми ему довелось жить и работать. Был справедлив к каждому человеку, какую бы должность он ни занимал. Классовые предрассудки были ему чужды. Он с горечью замечал, какие невосполнимые потери несёт его родина, оказавшись в плену неразгаданного народом деспотизма-сталинизма.

Мировоззрение В. К. Арсеньева, так или иначе, сказывалось в его поведении. И советские газеты стали цинично писать о том, что сквозь плащ у него просвечивают белогвардейские звёзды, а сам он – «белая кость». Бывший председатель Южно-Уссурийского отделения Русского географического общества А. З. Фёдоров на допросах следователя ОГПУ заявил: «… По своей идеологии Арсеньев был определённым контрреволюционером с ещё не изжитыми установками полковника, отставшего от жизни и замкнутого в своей литературной деятельности …». Это «признание» было высказано А. З. Фёдоровым, когда В. К. Арсеньева уже не было, но подобные «характеристики», можно предполагать, были и при его жизни. Владимир Клавдиевич душевно страдал от несправедливости и своего бессилия. В письме к Ф. Ф. Аристову, написанному летом 1930 г., он решился на откровенность: «Дорогой Фёдор Фёдорович! … За время революции и гражданской войны столько было насилий, столько пролилось крови, что у меня что-то надломилось в душе … В настоящее время моим раем и моим утешением являются дочь и жена. Я стал уставать от людей … Не понимаю, чего они хотят и почему так озлоблены на других! ... Не будь у меня семьи – я бы ушёл к друзьям туземцам, чтобы никогда не вернуться в город …».

Вскоре после данного откровения Арсеньев уехал в командировку в низовье Амура, откуда вернулся во Владивосток с очень подорванным от простуды здоровьем. Болезнь прогрессировала, и 4 сентября 1930 г. В. К. Арсеньева не стало. На похоронах тысячи людей шли за гробом; цветов и венков были горы.

Но уже тучи сгущались над его самыми близкими людьми. Весной 1934 г. была арестована его жена Маргарита Николаевна. 21 августа 1938 г. по приговору военной коллегии Верховного Суда СССР она, как соратница контрреволюционера, была расстреляна. Дочь Наталья Владимировна находилась в тюремных застенках в течение десяти лет (1941–1951) за «антисоветские высказывания», потеряв своё здоровье и право на нормальную человеческую жизнь. Мог ли предполагать В. К. Арсеньев, что государство учинит такую жестокую расправу над самыми дорогими ему людьми?

Замечательный путешественник, учёный, писатель заслужил своей многогранной деятельностью светлую и долгую память соотечественников. Это был действительно настоящий человек. Его именем назван город в Приморье, краевой Приморский музей во Владивостоке, улицы различных городов. Осуществились прогнозы В. К. Арсеньева, изложенные им в дневнике ещё в 1907 г.: «Пройдут долгие годы, но наша работа и труд, затраченные на изучение Уссурийского края, не пройдут даром, а принесут нашему Отечеству и потомству величайшую пользу. Верю, что через 40–50 лет нас будут вспоминать добрым словом».